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企业对环境问题的认识往往局限于生产过程中水，气，声，渣污染物的排放，忽略了生产过程中消耗的能源，资源，原材料，生产过程中产生的各种不同的废弃物，以及有毒有害
化学品的运输，储存，使用和处置过程中的环境污染。审核中常见的不符合有:
-未全具体地识别各种废弃物例如: 笼统地描述生产过程中排放的污水超标，未具体指明污水中主要的污染物。或未对废弃物的种类和性质进行分析，将可生物分-解的一般废弃物
和难降解的危险废弃物混为一体。
-未全评价产品的原材料消耗量和设备的能资源消耗水平
-未明确企业使用的有毒有害化学品的种类及其危害。例如:未识别使用农药、含臭氧层破坏物质(ODS)如哈龙1211型灭火器、氟利昂、含多氯联苯变压器的过程中产生的环境污染。
环境因素的识别、评价是一全而复杂的工作，靠一个部门的几个人员来做往往会造成遗漏。因此这项工作应由各部门抽调有经验并熟悉企业生产情况的技术人员应用多种方式
来收集、识别并评价企业生产活动、管理活动、服务过程、产品使用等方面的环境因素和重要环境因素。